گام بلند پژوهشگران بيوفيزيك دانشگاه تربيت مدرس در طراحي داروها با شبيه سازي ديناميك مولكولي، مدل سه بعدي ساختار سم عقرب ارائه شد

واضح آرشیو وب فارسی:شبكه خبر دانشجو: گام بلند پژوهشگران بيوفيزيك دانشگاه تربيت مدرس در طراحي داروها با شبيه سازي ديناميك مولكولي، مدل سه بعدي ساختار سم عقرب ارائه شد
نتايج شبيه سازي ديناميك مولكولي و اتصال مولكولي كه از سوي پژوهشگران بيوفيزيك دانشگاه تربيت مدرس انجام شد، نشان داد كه مدل سه بعدي ارائه شده از ساختار سم مدل مناسب و قابل قبولي است كه مي تواند در طراحي هدفمند داروها و عوامل مسدود كننده كانال هاي پتاسيمي كمك موثري كند.
به گزارش گروه علمي و آموزشي «شبكه خبر دانشجو»، 1 K-HEFUTOXINجزء سم هاي عقرب مسدود كننده كانال هاي پتاسيم در غشا بوده كه از عقرب گونه Heterometrus Fluvipes استخراج مي شود. اين يپتيد 22 اسيد آمينه اي داراي ويژگي ساختاري منحصر به فردي است كه آن را از سم هاي ديگر متمايز مي كند.

دكتر محبوبه ضرابي با بيان اين مطلب افزود: ساختار دوم اين يپتيد، داراي دو مارپيچ آلفا مي باشد كه با دو پيوند دي سولفيد به يكديگر متصل شده اند، جهت شناسايي ميانكنش اين سم با كانال هاي پتانسيل فعال شونده با ولتاژ (3، 1 ، 2، 1و 1،1 كيلو ولت در اين مطالعه، از نرم افزار DOCK- D 3 استفاده كرديم، همه ساختارهاي سم مورد نظر، در شبيه سازي مورد مطالعه قرار گرفت و نتايج نشان داد كوچكترين تغيير در ساختار سم قادر است، در شناسايي محل ميانكنش و همچنين اتصالات سم با كانال يوني تاثير گذارد.

وي در ادامه گفت:1 K-HEFUTOXIN در بخش خارجي كانال هاي پتانسيم قرار گرفته و قادر است با برخي از اسيد آمينه هاي موجود در ساختار مارپيچ آلفاي خود با كانال ميانكنش دهد.

دكتر ضرابي در تشريح نتايج اين پژوهش كه در قالب رساله دكتراي تخصصي وي انجام و ارائه شده، تصريح كرد: نتايج شبيه سازي نشان داد در ميانكنش سم هاي باردار مفني با كانال هاي يوني حضور ميانكنش هاي ئيدروفوبي اهميت ويژه اي داشته و وجود آنها براي پايداري اتصالات در طول زمان ضروري است.

نتايج شبيه سازي ديناميك مولكولي و اتصال مولكولي نشان داد كه مدل سه بعدي ارائه شده از ساختار سم در ميانكنش باكانال هاي پتاسيم، مدل مناسب و قابل قبولي بوده و مي تواند در طراحي هدفمند داروها و عوامل مسدود كننده كانال هاي پتاسيمي كمك موثري كند.

لازم به ذكر است، اين پژوهش با راهنمايي دكتر حسين نادري منش در دانشكده علوم پايه دانشگاه تربيت مدرس انجام شد./انتهاي پيام/
دوشنبه 30 دي 1387

این صفحه را در گوگل محبوب کنید

[ارسال شده از: شبكه خبر دانشجو]

[مشاهده در: www.snn.ir]

[تعداد بازديد از اين مطلب: 243]