گام بلند پژوهشگران بيوفيزيك دانشگاه تربيت مدرس در طراحي داروها با شبيه سازي ديناميك مولكولي، مدل سه بعدي ساختار سم عقرب ارايه شد

واضح آرشیو وب فارسی:ايسنا: گام بلند پژوهشگران بيوفيزيك دانشگاه تربيت مدرس در طراحي داروها با شبيه سازي ديناميك مولكولي، مدل سه بعدي ساختار سم عقرب ارايه شد
خبرگزاري دانشجويان ايران - تهران
سرويس: علمي

نتايج شبيه سازي ديناميك مولكولي و اتصال مولكولي كه از سوي پژوهشگران بيوفيزيك دانشگاه تربيت مدرس انجام شد، نشان داد كه مدل سه بعدي ارائه شده از ساختار سم مدل مناسب و قابل قبولي است كه مي‌تواند در طراحي هدفمند داروها و عوامل مسدود كننده كانالهاي پتاسيمي كمك مؤثري نمايد.

به گزارش سرويس علمي خبرگزاري دانشجويان ايران (ايسنا)، K-HEFUTOXIN1 جز سم‌هاي عقرب مسدود كننده كانال‌هاي پتاسيم در غشا بوده كه از عقرب گونه HETEROMETRUS استخراج مي‌شود .

اين پپتيد 22 اسيد آمينه‌اي داراي ويژگي ساختاري منحصر به فردي است كه از آن سمهاي ديگر متمايز مي‌كند.

دكتر محبوبه ضرابي محقق دانشگاه تربيت مدرس با بيان اين مطلب، افزود: ساختار دوم اين پپتيده داراي دو مارپيچ آلفا مي‌باشد كه با دو پيوند دي سولفيد به يكديگر متصل شده‌اند .

جهت شناسايي ميانكش اين سم با كانال‌هاي پتاسيم فعال شوند با ولتاژ (KV1,3-KV1,2-KV1,1) در اين مطالعه، از نرم‌افزار 3D-DOCK استفاده نموديم.

همه ساختارهاي سم مورد نظر، در شبيه سازي مورد مطالعه قرار گرفت و نتايج نشان داد كوچكترين تغيير در ساختار سم قادر است در شناسايي محل ميانكش و همچنين اتصالات سم با كانال يوني تاثير گذارد.

وي در ادامه گفت: K-HEFUTOXIN1 در بخش خارجي كانال‌هاي پتاسيم قرار گرفته و قادر است با برخي از اسيد آمينه‌هاي موجود در ساختار مارپيچ آلفاي خود با كانال ميانكش دهد.

اسيد آمينه‌هاي TYR5 ,ARG6 ,TRP9 ,LYS19 ,ARG10 از سم و اسيد آمينه‌هاي HIS404 ,THR407 ,GLY401 ,ASP386 در هر يك از زير واحدهاي كانال‌هاي پتاسيم، از اسيد آمينه‌هاي مهم و كليدي جهت ميانكش K-HEFUTOXIN1 با كانالهاي پتاسيم مي باشند.

نتايج شبيه سازي ديناميك مولكولي و اتصال مولكولي نشان داد كه مدل سه بعدي ارائه شده از ساختار سم در ميانكش با كانالهاي پتاسيم، مدل مناسب و قابل قبولي بوده و مي‌تواند در طراحي هدفمند داروها و عوامل مسدود كننده كانالهاي پتاسيمي كمك مؤثري نمايد.

گفتني است، اين پژوهش با راهنمايي دكتر حسين نادري در دانشكده علوم پايه دانشگاه تربيت مدرس انجام شد.

انتهاي پيام
دوشنبه 30 دي 1387

این صفحه را در گوگل محبوب کنید

[ارسال شده از: ايسنا]

[مشاهده در: www.isna.ir]

[تعداد بازديد از اين مطلب: 250]