تور لحظه آخری
امروز : پنجشنبه ، 12 مهر 1403    احادیث و روایات:  پیامبر اکرم (ص):غيبت كردن در (نابودى) دين مسلمان مؤثرتر از خوره در درون اوست.
سرگرمی سبک زندگی سینما و تلویزیون فرهنگ و هنر پزشکی و سلامت اجتماع و خانواده تصویری دین و اندیشه ورزش اقتصادی سیاسی حوادث علم و فناوری سایتهای دانلود گوناگون شرکت ها




آمار وبسایت

 تعداد کل بازدیدها : 1820230017




هواشناسی

نرخ طلا سکه و  ارز

قیمت خودرو

فال حافظ

تعبیر خواب

فال انبیاء

متن قرآن



اضافه به علاقمنديها ارسال اين مطلب به دوستان آرشيو تمام مطالب
 refresh

راه اندازی پایگاه اطلاعاتی قطعات پپتیدی در کشور


واضح آرشیو وب فارسی:ایسنا: سه‌شنبه ۵ اسفند ۱۳۹۳ - ۱۱:۲۲



نخستین پایگاه اطلاعاتی قطعات پپتیدی در کشور توسط عضو هیات علمی دانشگاه تربیت مدرس راه اندازی شد. به گزارش سرویس فناوری ایسنا، استفاده از قطعات پپتیدی کاربردهای وسیعی در زیست شناسی نوین دارد. در طراحی پروتئین های نوترکیب، ترکیب دمین های پروتئینی از طریق توالی های اتصال دهنده الیگوپپتیدی صورت می گیرد. قطعات پپتیدی همچنین به عنوان پپتیدهای دارویی نیز برای درمان برخی بیماری ها کاربرد دارند. علاوه بر موارد ذکر شده قطعات پپتیدی کاربردهای بسیاری در طراحی پروتئین نیز ایفا می کنند. دکتر شهریار عرب، عضو هیات علمی دانشگاه تربیت مدرس و طراح و مجری این پایگاه با بیان کاربرد این نرم افزار در طراحی پپتید، طراحی لینکر و مهندسی پروتئین گفت: به منظور تسهیل در فرایند انتخاب قطعات پپتیدی، پایگاه داده و نرم افزاری تحت وب با عنوان «لیندا» (LinDA) طراحی شده است. این نرم افزار توانایی جستجو در پایگاه داده حاوی بیش از 120 میلیون قطعه پپتیدی استخراج شده از حدود ۱۴ هزار ساختار پروتئینی گرفته ­شده از بانک داده پروتئین­ها (PDB) را دارد. ویس تصریح کرد: ورودی این برنامه شامل طول توالی و همچنین فاصله­ بین انتهای آمینی و انتهای کربوکسیلی است. لیندا می­ تواند با در نظر گرفتن ورودی­ های دیگر از قبیل محتوای اسید آمینه­ یی، ساختار دوم، قطبیت و دسترس­پذیری به حلال به صورت اختیاری، قطعات پپتیدی مناسب ­تری را پیشنهاد دهد. خروجی این نرم ­افزار فهرستی از قطعات پپتیدی شامل اطلاعاتی از قبیل فایل pdb قطعه پپتیدی، محتوای اسید آمینه­ یی، الگوی قطبیت، الگوی دسترس­ پذیری به حلال، فاصله­ بین انتهای آمینی و انتهای کربوکسیلی توالی، الگوی ساختار دوم و همچنین کد و لینک pdb ساختار پروتئینی که قطعه پپتیدی از آن استخراج شده­ است. این نرم افزار به صورت رایگان در پایگاه اینترنتی آزمایشگاه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس در نشانی http://bioinf.modares.ac.ir/software/linda در دسترس می باشد. انتهای پیام
کد خبرنگار:







این صفحه را در گوگل محبوب کنید

[ارسال شده از: ایسنا]
[مشاهده در: www.isna.ir]
[تعداد بازديد از اين مطلب: 34]

bt

اضافه شدن مطلب/حذف مطلب







-


علم و فناوری

پربازدیدترینها
طراحی وب>


صفحه اول | تمام مطالب | RSS | ارتباط با ما
1390© تمامی حقوق این سایت متعلق به سایت واضح می باشد.
این سایت در ستاد ساماندهی وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی ثبت شده است و پیرو قوانین جمهوری اسلامی ایران می باشد. لطفا در صورت برخورد با مطالب و صفحات خلاف قوانین در سایت آن را به ما اطلاع دهید
پایگاه خبری واضح کاری از شرکت طراحی سایت اینتن